再生障碍性贫血的原因主要和自身免疫因素有关，有部分患者与病毒的感染有关。研究发现，前期发生病毒感染的情况，容易干扰自身的免疫系统，造成自身免疫功能紊乱，进而影响骨髓的造血功能，引起再生障碍性贫血的发病。

　　也有部分患者是因为药物而引起再生障碍性贫血，例如使用氯霉素后，容易引起骨髓造血功能异常，出现再生障碍性贫血的发病。

　　有部分患者是因为理化因素，例如长期接触一些放射线所导致的再生障碍性贫血。也有少部分患者是因为长期接触一些化学物质所发病的，例如长期接触一些甲醛，有可能会影响骨髓造血功能，导致再生障碍性贫血发病。