专家说任何手术都会有出现后遗症的可能，只要是手术，都会存在风险，所以卵巢囊肿手术也不例外，但是女性也不必过分担心，如果女性选择正规医院手术治疗卵巢囊肿，如术后无感染，伤口愈合良好，一般不会留下后遗症的。如果采用传统手术治疗的，则创伤比较大，恢复的时间长。而腹腔镜微创技术创伤小，恢复快，加上术后女性重视修养，一般是不会有后遗症。不过手术中极易引起早产，如大妊娠末期发现患有卵巢囊肿，则妨碍分娩，引起尿潴留或阻塞性难产。
卵巢囊肿手术后遗症
可能出现术后感染
卵巢囊肿患者大部分是做的囊肿的剔除术，手术中难免会有出血以及手术的创伤面。若是手术中没有控制好出血量、以及创伤面，就会导致术后有感染出现。因此术后感染可以说是卵巢囊肿的第一后遗症。
可能影响卵巢功能
卵巢囊肿的手术，除了是剔除多余的囊肿外，有时候还需要对粘连在卵巢上的输卵管进行剥离，以免粘连在卵巢周围的输卵管影响到卵巢的正常排卵功能。因此，手术过程中，第二大后遗症就是有可能会影响到卵巢、输卵管伞端的正常功能。
能影响月经
卵巢囊肿的手术后，由于剔除掉囊肿，有可能会出现排卵延迟，打乱原有的排卵周期，这样就会直接影响到月经的来临。换句话说就是，卵巢囊肿的手术后，患者会出现月经延迟会月经延后，这是手术后的第三个后遗症。