巧克力囊肿是“肿块”但并非是“肿瘤”，它是子宫内膜异位症的一种病变。正常情况下，子宫内膜生长在子宫腔内，受体内女性激素的影响，每月脱落一次，形成月经。如果月经期脱落的子宫内膜碎片，随经血逆流经输卵管进入盆腔，种植在卵巢表面或盆腔其他部位，形成异位囊肿，这种异位的子宫内膜也受性激素的影响，随同月经周期反复脱落出血，如病变发生在卵巢上，每次月经期局部都有出血，使卵巢增大，形成内含陈旧性积血的囊肿，这种陈旧性血呈褐色，粘稠如糊状，似巧克力，故又称“巧克力囊肿”。这种囊肿可以逐渐增大，有时会在经期或经后发生破裂，但很少发生恶变。
卵巢囊肿是指卵巢内有囊性的肿物形成，可分为肿瘤性和非肿瘤性两类。肿瘤性囊肿即为卵巢肿瘤，非肿瘤性囊肿包括卵巢的功能性囊肿以及子宫内膜异位囊肿。
巧克力囊肿三大早期症状：
早期症状一：不正常的经痛。痛经是子宫内膜异位最明显的症状，却是最容易忽略的先兆。
早期症状二：性变疼痛。这也是一个明显的信号，可能还伴有点状出血。
早期症状三：没有避孕也不会怀孕。在不孕的女性中，子宫内膜异位造成的不孕占有很高的比例。
在很多子宫内膜异位是B超也不一定查得出来的。医生有时可能通过内诊接触到异物，但最准确的方法还是腹腔镜的检查。
子宫内膜异位约80%发生在卵巢，约50%为双侧性。因异位的子宫内膜有周期性出血、纤维化及粘连逐渐形成囊肿。内含陈旧性血液称巧克力囊肿。直径多在3cm以内，但也可很大。
CT表现：于附件及子宫直肠陷窝处可见圆形或椭圆形囊肿，边缘光滑、锐利，境界清晰，具有典型囊肿的CT特征。直径一般3～5cm，密度均匀一致，CT值近于水，但巧克力囊肿因系陈旧性血液而CT值偏高。壁薄。
根据B超检查，结合临床的表现一般就可以确诊，巧克力囊肿的声像图特点为圆形或椭圆形的低回声区，囊壁相对较厚，厚度基本均匀，边界往往因粘连而欠清，囊壁由于液体粘稠及血块粘附而不平，囊液透声差，内部含大量细小密集光点，而成低回声，时间较长的囊肿内可以有凝固的血块，而出现中高回声区，使内部回声不均匀，形态不规则，囊腔内还可探及纤维组织形成的光带，构成完全性或不完全性分隔，彩色多谱勒囊壁可探及阻力较高的血管。
卵巢囊肿的临床表现：
1.下腹不适感
2.腹围增粗腹内肿物
3.腹痛
4.月经紊乱
5.压迫症状
巨大的卵巢肿瘤可因压迫横膈而引起呼吸困难及心悸，卵巢肿瘤合并大量腹水者也可引起此种症状；但有的卵巢肿瘤患者的呼吸困难系由一侧或双侧胸腔积液所致；