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一、免疫学检查可以确定是否存在自身免疫、染色体核型分析可确定是否存在染色体异常。测定血清FSH、LH、T、PRL是少精子症检查的重要方法，也有助于辨别是原发性睾丸功能衰竭还是继发性睾丸功能衰竭。
二、睾丸B超可发现睾丸大体病变，睾丸活检可提供更加确实的诊断治疗依据。
三、精液的生化检查
目前开展较多的是果糖、酸性磷酸酶、柠檬酸、蛋白质、微量元素、乳酸脱氢酶X等。
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