皮肤结核应视为全身感染的一部分，强调早期、足量、规则、全程及联合使用3～4种抗结核药物，以保证疗效，延缓或防止结核分枝杆菌的耐药性。必要时配合外科治疗。
1、系统治疗
一线抗结核药物包括利福平、异烟肼、吡嗪酰胺、乙胺丁醇、利福喷丁、利福布丁；二线抗结核药物包括环丝氨酸、乙硫异烟胺、丙硫异烟胺、氨苯硫脲、对氨基苯甲酸、卷须霉素、紫霉素、链霉素、丁胺卡那霉素、卡那霉素、左氧氟沙星、加替沙星、莫西沙星。
治疗皮肤结核成人标准的6个月治疗方案为：最初2个月口服利福平（10mg/kg），异烟肼（5mg/kg）、吡嗪酰胺（35mg/kg）和乙胺丁醇（15mg/kg）；后4个月的持续治疗阶段口服利福平和异烟肼治疗。如果患者对异烟肼没有产生耐药性，可以不加用乙胺丁醇。HIV感染的患者持续治疗需要更长时间，至少7个月以上。
2、手术疗法
早期、较小的寻常狼疮或疣状皮肤结核的皮损可行手术切除。外科治疗对瘰疬性皮肤结核也有效果。寻常狼疮留下的瘢痕可行整形手术治疗。