扁平苔藓一般不会自行痊愈。扁平苔藓目前发病原因并不清楚，考虑与免疫、遗传、病毒感染、精神因素等有关系，有些扁平苔藓的患者会合并自身免疫性疾病，比如桥本氏甲状腺炎、溃疡性结肠炎等。
扁平苔藓目前临床上没有什么特效的治疗方法，一般都是采用综合性治疗的方法，常用的比如糖皮质激素、他克莫司、维A酸软膏，有些患者可以尝试应用糖皮质激素局部注射来进行治疗。
某些患者因为有剧烈的瘙痒，可以口服抗组胺类药物，比如西替利嗪、扑尔敏等。还有一些患者可能会出现糖皮质激素不敏感的情况，可以考虑用免疫调节剂，比如羟氯喹。