第一种，免疫抑制治疗：采用糖皮质激素。有些病人可根据配偶月经周期接受1～3个疗程后，有受孕的可能。但大剂量激素治疗时，近2/3的病人出现副反应，如体重增加、烦躁、情绪改变、痤疮、水肿、皮疹等。
第二种，睾丸反跳疗法：有少数自身免疫性不育的男子，精子数量并不减少，有的甚至很多，因此抗精子抗体的数量也骤增。
第三种，病因治疗：生殖系统感染时，输精管道水肿梗阻，以及微生物对血睾屏障的破坏均可引起抗体产生，导致不育。因此，对男性生殖道炎症应积极治疗，抗感染治疗越早、越及时越好，一般治疗期限以6～12个月为佳。对因睾丸组织损伤和附睾病变产生自身抗精子抗体导致不育者，应手术治疗，消除免疫反应的病灶，有可能改善生育能力。
第四种，精子洗涤和宫腔内人工授精。
第五种，中医药治疗：有人采用纯中药制剂还精煎，辅以小剂量强的松，治疗血清自身抗精子抗体阳性者，结果自身抗精子抗体消失率达95%。大量报告证实采用温阳补肾、填精益髓、活血化瘀、清热解毒的中药治疗后，活动精子平均向前运动速度随之加快，精液中脓细胞检测率也随之下降。