避孕药的种类很多，不管是长效的还是短效的，它们的作用机制是相同的，都是通过抑制排卵达到避孕的目的。正常女性有自己的内分泌规律，由于口服避孕药的使用，而使其自身的规律紊乱，所以在服药过程中会有一些副作用产生，可能导致内分泌紊乱、月经不调、闭经，不孕，或者肠胃不适、头痛、体重增加、神经紧张、情绪低潮、皮肤色斑和粉刺等。服用避孕药还可能会对身体造成以下危害：
1、避孕药对糖、蛋白质、脂肪代谢都有一定的影响，会降低糖耐量。
2、避孕药会使脂蛋白水平增高，促使血压升高、动脉硬化。
3、避孕药主要是雌激素的作用，雌激素用量高会使凝血因子增高，增加血栓性疾病发生的危险性。
4、避孕药物会影响胆汁的排泄功能，长期用药还会造成肝功能异常。
因此，建议女性不要把避孕药做为长期的避孕措施使用。避孕药吃多了对女性危害较大，一般来讲，口服避孕药用6个月以上应停服2—3个月，使被抑制的卵巢功能得以恢复，停药一段时间后还可以继续服用。
避孕药会影响月经周期。吃了紧急避孕药后约一周左右的时间，有些女性会出现少量的阴道出血的情况。服用避孕药后月经周期被打乱，可能会出现月经提前或月经推迟的情况，之后月经周期重建，慢慢恢复正常。
育龄妇女在月经周期的不同时间内服用避孕药，其对月经的影响也会有所不同。如果是在前半个月经周期内服用，可能对妇女的月经干扰较大，易出现阴道出血;在后半个月经周期内服用则对妇女月经干扰较小。
由于个体差异的不同，服药者对紧急避孕专用药的反应也有所不同。少数妇女在服用后，短时间内会有阴道出血发生，如其出血量与平时月经量差不多，可将其当作一次月经，出血干净后应立即采取常规避孕方法。如出血量很少，则不需要做任何处理，但仍需注意避孕，直到下次月经来潮。
严格按照说明书使用紧急避孕药，一般对人体没有影响，但如果长期或大量服用，可能使月经周期变得不规则，建议不要长期或大量服用紧急避孕药。
避孕药由于其抑制、延迟排卵的作用和抑制子宫内膜的作用，可使下次月经延期，也可能由于临时用药造成的一次性血液中激素水平的暂时升高，下降后发生撤退性出血，表现为月经提前。这都是避孕药的副作用表现，这一般是不需要治疗的，注意卫生就可以了，出血期间禁止性生活，禁食辛辣刺激食物。一般停药2－3个月月经可以恢复。吃了避孕药出血，可以采取以下方法改善情况：
1、少量出血者，每晚加服炔雌醇1片（0.005毫克），与避孕药同时服到22天停药。
2、出血稍多者，每晚加服炔雌醇2片（0.01毫克），与避孕药同时服到22天停药。
3、出血量如同月经量时，或出血时间已接近月经期，可停止服药，就将此次出血当作月经，在出血的第五天开始重新服药。
4、如不愿使用加服炔雌醇防止出血的方法，可调换药品，即原来采用1号药出血者，可改服2号药，原服2号药出血者，可改服1号药。但必须服完一个周期即22天的药后，方可调换。
5、使用埋植剂及甲孕酮避孕针的妇女，常有20—30%有不规则阴道出血，但会随着使用时期的延长而逐步好转。如果出血不能忍受，可以停药或加用雌激素均可止血。
6、正确掌握服药方法，养成按时服药的习惯，妥善保管药品，发现药片受潮、糖衣层磨损、崩裂，就不能服用。