甲状腺囊肿不会自愈，多数甲状腺囊肿为良性病变。短时间内不会发生巨大变化，但是也不会自行消失。对于甲状腺囊肿较大的患者来说，如果对周边组织有压迫症状或形态不规则，边界模糊有恶变趋势者，可以采取微创或手术治疗。

　　微创包括细针抽吸、硬化剂的治疗。手术包括甲状腺部分切除等措施，术后发生甲状腺功能改变者，还需要对症采取相应的措施。