颌骨囊肿摘除手术后的后遗症主要与患者的病情相关，因为颌骨囊肿分为多种类型，由于发病部位、原因以及病情的严重程度等不同，所产生的后遗症也会有所差异。

　　例如上颌骨囊肿的患者在手术后可能会出现牙齿松动的情况，在囊肿切除后如果骨体强度不够，可能形成病理性的骨折。如果颌骨囊肿的体积过大压迫到神经，在手术后如果无法保留神经的患者可能会形成口唇麻木的后遗症。

　　另外有些患者由于治疗不及时，囊肿体积过大，手术切除后面部畸形的情况仍然存在，影响患者的面容美观，此时可以通过骨移植或者赝复体进行修复。