垂体性侏儒症的病因可分为三种类型：

　　一、原发性病因：多数患者原因并不明确，也没有家族史，仅仅是小部分有家族性发病史，主要为常染色体隐性遗传。

　　二、继发性病因：继发性比较少见，导致垂体前叶或下丘脑损伤的因素，如感染、外伤、血管坏死以及X线损伤等等，或者是垂体本身或其周边的肿瘤，如颅咽管瘤、视交叉或下丘脑的胶质瘤、垂体黄色瘤等可压迫垂体，这些都可以引起垂体分泌生长激素不足，导致生长发育停滞。

　　三、特发性垂体性侏儒症，可以是单纯生长激素缺乏，或同时有多种垂体前叶激素的缺乏。