慢性肠胃炎的患者如果没有任何不适的症状，且没有幽门螺杆菌的感染，是不需要用药的。如果有消化道的症状，可以根据症状进行对症治疗，如果有腹泻症状，可以服用蒙脱石散、药用炭治疗。如果有反酸、嗳气、呃逆等症状，可以服用奥美拉唑、泮托拉唑、枸橼酸铋钾等药物缓解症状，同时可以服用双歧杆菌四联活菌调节肠道菌群。

　　对于有幽门螺杆菌感染的慢性胃肠炎患者，需要应用呋喃妥因、克林霉素、阿莫西林、甲硝唑等抗生素进行清除幽门螺杆菌治疗，同时应用一种质子泵抑制剂和一种胃黏膜保护药物。