舌咽神经痛目前没有一个非常准确的诊断标准，各个地方或者说各个国家指定的诊断标准都有点出入。

　　第一个必须有发作性的咽喉部疼痛，这种疼痛往往是闪电样和刀割样，还有可能是这种烧灼感。第二，这种疼痛一定是发作性的，而不能是持续性的，跟神经疼的一个特点相关。神经疼主要是因为神经内部的过度放电，造成神经末梢不断的释放这种神经递质，这种递质是量子化的，成批的释放，而不是持续的释放。

　　因此正常情况下，舌咽神经痛和或者说其所有的神经痛都是发作性的，这种情况首先是神经痛的特点，第二是疼痛的部位，主要是在咽喉部，或者是在舌根部，个别情况下可以放射到颈部。第三是它的诱因，说话、语言表达、喊叫、唱歌、吞咽或者是刷牙这些动作，都或多或少的可以诱发舌咽神经痛。

　　因此从症状、疼痛特点，还有发作的部位来讲，可以拟诊舌咽神经痛，但同时要除外舌咽神经痛其他的一些继发性的因素，比如说咽喉部的脓肿，化脓性扁桃体炎，椎前脓肿，颈椎的病变，这些也会产生类似于舌咽神经痛的症状，但是它本身并不是舌咽神经痛，因此要把这些疾病除外以后，才能够诊断舌咽神经痛。