那么首先从发病的原因，它们是不同的。引起细菌性痢疾的病原体主要是痢疾志贺杆菌，也就是痢疾杆菌所导致的，属于细菌一类的一些微生物。那么引起阿米巴痢疾主要是一些溶组织阿米巴原虫所导致的。阿米巴属于原虫类的，属于寄生虫。这是发病原因的不同。其次是一些临床表现，临床症状不同。细菌性痢疾是以结肠的化脓性的炎症和溃疡性的炎症为基本的病理表现，主要表现为腹痛，粘液浓血便，里急后重等这些症状.而阿米巴痢疾主要是出现腹痛腹泻，排一些暗红色果浆样的大便为特征的。因为阿米巴痢疾它的病变主要是在盲肠和升结肠。