绝大多数患儿适当治疗可以逐渐康复，预后良好，没有并发症的川崎病可以治好的。川崎病的治疗包括急性期治疗和合并冠脉瘤患儿的恢复期的治疗。急性期治疗包括静注人免疫球蛋白、口服阿司匹林等等。在发病的早期也就10天以内，大剂量使用静注人免疫球蛋白可以降低冠状动脉发生率，在用药后发热和其他的炎症反应表现大多数在1-2天内可以迅速恢复。

　　恢复期的治疗主要包括抗血小板凝聚以及对症治疗，严重的冠状动脉病变可能需要手术治疗。但是有5%-9%的川崎病患儿可以发生冠状动脉并发症，极少数可能会由于冠状动脉破裂、血栓闭塞、心肌梗死或者是心肌炎而死亡。冠状动脉瘤大多数在2年内自行消失，可能会遗留管壁的增厚或者是弹性减弱等功能异常。大的动脉瘤常通常不容易完全消失，可能会导致血栓形成或者管腔狭窄。大约有1%-2%的川崎病患儿会出现复发。