引起慢性腹泻的病因有很多，其中最常见的有肠易激综合征、慢性功能性腹泻、抗生素相关性腹泻及炎症性肠病等。其主要治疗原则是针对不同病因，采取相应的治疗。对于严重腹泻严重者，可以用止泻药物进行治疗。对于有腹泻腹痛的病人，可以用解痉止痛药进行治疗。

　　临床上包括：

        第一饮食疗法：避免服用诱发腹泻的食物。这种情况要因人而异，一般要少食产气多的食物，如乳制品和豆制品。

        第二微生态制剂。 

        第三合理应用抗生素，抗生素应在医生指导下应用。

        第四予以镇静剂或心理治疗。