医学上较少提到治疗肠上皮化生，但需要关注的是病理结果。

　　对于完全性肠上皮化生或者是小肠型化生，不必过分惊慌。但对于中、重度不完全性肠上皮化生或大肠型化生需要高度重视，密切随访，建议每6~12个月随访一次胃镜检查，以监测病情变化。一旦进展为不典型增生，才建议手术或者镜下干预。

　　轻度肠化如果有幽门螺杆菌感染，必须积极根除，如果没有大家也不必惊慌。目前门针对肠上皮化生的药物基本没有，西药可以用一些保护胃粘膜的药，中药可以选择一些治疗萎缩性胃炎的药物。