巧克力囊肿引起的主要原因，目前我们还不是特别清楚。大多倾向于一个是经血逆流还有在位内膜异位，主要是因为内膜异位到卵巢之后，反复的有出血也不能排出。再反复的出血，循环反复，长久形成巧克力样的囊肿，这样形成的。