肉毒综合征的处理主要是根据以下原则：容易反复运动的肌肉易疲性是临床的特征;预测到并发症的发生是最好的预防；细致的支持治疗是必须的，喂养和支持呼吸，正确的体位对保持呼吸道通畅和改善呼吸功能。病人尽量脸向上放在一张硬底的小床上，头抬高30度，用小布卷垫在颈椎下以抬高头的后部，使分泌物流入咽后部避免进入呼吸道。

　　预防性地进行气管插管以维持气道通畅和避免吸入。使二氧化碳分压维持在正常范围之内。母乳是最佳的食品，尽可能经鼻胃管或鼻空肠管给予喂养患儿，直至口咽恢复协调运动后，停止经鼻胃管。

　　没有并发症的婴儿或食物型肉毒中毒一般不需抗生素治疔。创伤型的肉毒中毒需要用抗生素和抗毒素积极治疗。