肛门和直肠的发育发生在第4周和6个月期间，直肠肛门畸形的发生是胚胎发育期发生障碍的结果。男性和女性基本上是相同的，仅是解剖上的区别，泄殖腔分隔过程的结果。尿生殖窦与肛门直肠窦之间相通，构成高位或中间位畸形，发生各种肛门直肠发育不全及直肠与尿道或阴道间的瘘管，肛门后移过程障碍和会阴发育不全的结果，构成低位畸形，发生肛门皮肤瘘，肛门前庭瘘，肛门狭窄等。

　　要预防先天性肛门直肠畸形，孕前应该做好优生优育检查，积极治疗原发疾病;孕期避免接触有毒、有害、有辐射的物品，定期产检，保持心态平和，饮食摄入营养均衡，同时，还应该保证高质量的睡眠。