衣原体阳性，一般治疗需要用抗菌药物，可以选择以下几大类：

　　第一类可以选择四环素类，比如多西环素、米诺环素、强力霉素。

　　第二类可以选择红霉素类，也就是大环内酯类的，可以用克拉霉素、阿奇霉素。

　　第三类可以用喹诺酮类，可以选择左氧氟沙星以及莫西沙星，这是抗感染治疗。疗程一般要看哪个部位了，如果是衣原体引起的，肺炎衣原体引起的肺炎一般疗程是在7到14天。如果是沙眼衣原体引起的泌尿生殖道的感染，一般疗程是7天。如果是鹦鹉热衣原体引起的肺部炎症，疗程是10到21天。另外沙眼衣原体还可以引起沙眼以及包涵体的结膜炎，这个时候还要应用局部的眼药水或者是软药膏，以上抗生素的这些眼药水都可以选择。

　　如果沙眼衣原体引起的倒睫以及尿道的狭窄，另外还有一些不孕症，这个时候可能就需要外科来治疗。