隔肌膨出的危害主要有两点。首先是膈肌膨出之后，造成患者胸腔内容积减小。先天性膈肌膨出的病人，可能会造成心肺发育不良，甚至出现胃扭转，严重影响患儿的生长发育，甚至会因为肺功能衰竭而死亡。后天膈肌膨出的病人，绝大部分是因为膈神经损伤造成的，隔肌膨出也会造成患者胸腔容积减小，病人会出现下肺基底段的不张，影响患者呼吸功能，甚至会出现下肺的反复感染。

　　隔肌膨出的第二个危害是膈肌麻痹，膈肌发育不良，造成患者膈肌功能丧失。正常呼吸是靠膈肌运动的，而隔肌膨出之后，会造成患者膈肌功能丧失，因此病人的呼吸功能受影响，肺通气功能降低，造成病人出现胸闷、气促等症状。