房间隔缺损一般不会有手术后遗症，其与手术方式和病情的判断有很大关系，其中手术方式一种是介入封堵，另外一种是外科手术。介入封堵不适用于房间隔缺损较大或边缘较弱者，避免封堵器的脱落或是移位，磨损心房组织导致心脏传导束受损。

　　另一种方式为外科手术，例如下腔型房间隔缺损修补有可能会导致下腔静脉的异位引流、肺静脉的异位引流。根据医疗技术水平，对这个疾病的判断，选择合适的手术方式，当手术方法得到了充分的预估和判断，一般是很少有并发症发生的。