心脏官能症的药物治疗以镇静的药物为主，最常用的药物为苯二氮卓类镇静药。有些患者表现为明显的焦虑、紧张等症状。苯二氮卓类镇静药物可以减轻患者焦虑的症状，症状较轻的患者给予短效的镇静药物，如果患者症状偏重可以给予作用时间较长的镇静药物，比如氟西泮。

　　有些患者表现为抑郁的症状，可以给予抗抑郁的药物治疗，常用的药物为三环类的抗抑郁药物，此类药物副作用较多，服用过程中要观察病情变化。还可以给予新型的抗抑郁药物，比如舍曲林，副作用比较小，相关性比较好。药物治疗的同时要给予患者心理疏导，减轻患者的压力。