肛瘘一般情况下是不会自愈的。因为肛瘘是一个异常的通道，它是从直肠通向肛门周围皮肤的，它是由内口、外口以及瘘管组成的。只有把这个通道彻底的清除，才可以完全愈合。否则通过治疗，外口有可能出现短暂的愈合，但是通道和内口依然存在，就会有内分泌物出现，肛瘘就很容易复发。

　　彻底治愈肛瘘就可以选择手术治疗，也可以选择挂线治疗。手术治疗时，可以直接把瘘管切开，形成开放性的通道，这样有利于创面愈合，也可以直接把瘘道切除。挂线疗法是用医用线或者是橡皮筋把瘘管切开。