小儿百日咳主要是因为感染百日咳杆菌，而引起的急性上呼吸道传染性疾病，因此主要是进行抗感染治疗。

　　目前对于百日咳杆菌比较有效的药物是大环内酯类抗生素，例如环酯红霉素或阿奇霉素，能够有效的抑制百日咳杆菌的活性。对于病情比较轻微的可选择口服药物治疗，病情比较严重的需要静脉输液治疗。

　　另外，因为百日咳主要临床症状就是阵发性痉挛性咳嗽，因此可以配合使用特布他林联合布地奈德进行雾化吸入治疗，能够快速的缓解咳嗽症状。对于病情比较严重的患儿，可静脉用丙种球蛋白来治疗。