病情分析：咽喉疼痛咳嗽主要考虑是支气管或者是咽部疾病，衣原体不会侵犯呼吸道，只是感染眼结膜和生殖泌尿道。

处理意见：成年人衣原体感染主要是感染生殖泌尿道，也就是非淋菌性尿道炎，这是一种性病，主要通过无套性生活传染，感染之后的症状是尿道或者女性阴道有特殊的分泌物，同时伴有尿急尿频尿痛的症状。