肠系膜上动脉血栓形成，并不会遗传。肠系膜上动脉血栓的栓子主要来源于心脏，如心肌梗死后的腹壁血栓，亚急性细菌性心内膜炎的瓣膜赘生物，风湿性心脏瓣膜病，便处的赘生物和左右心眼腹壁血栓的脱落等。也可来源于大动脉粥样硬化的腹壁血栓或粥样斑块的脱落和脓肿和脓毒血症的细菌的栓子

　　肠系膜动脉栓塞的发生，也可与肠系膜上动脉的解剖结构有关系。肠系膜上动脉从腹主动脉呈锐角分出，与主动脉走形平行，管腔较粗，与腹主动脉血流的方向一致，脱落的栓子易于进入。