第三腰椎横突综合征的鉴别主要是以强直性脊柱炎相鉴别，主要表现为休息疼痛，腰部活动明显受限，脊柱可能有叩击的疼痛，通常HLA-B27多为阳性，其X线检查可以见到腰椎的边缘增生为骨赘和周围钙化。

　　第二还有可能有陈旧性的外伤的骨折病史，表现为不同程度的腰部功能受限，X线可以见到椎体有压缩性的骨折。

　　还有就是腰间盘突出的相鉴别，包括有固定的肌间或者肌旁压痛，疼痛时可以向下肢进行放射疼痛，腰后伸的时候压痛点加重，有时候可以持续性加重一侧和双侧的坐骨神经疼痛。还有可以因咳嗽、打喷嚏等诱发，其直腿抬高实验是阳性的。