肛周囊肿的主要治疗方法一般是分为药物的保守治疗以及通过手术的方法进行治疗。还有一部分早期的囊肿患者，囊肿的体积比较小，对于患者不会产生任何的影响，也可以不进行治疗，以观察为主。肛周囊肿是属于表皮样的囊肿，生长较为缓慢，如果没有任何症状的，一般可以先观察为主。

　　如果肛周囊肿出现了局部感染的，有局部红肿热痛的，影响到患者生活的，可以先进行抗生素药物的保守治疗。对于囊肿反复的发作或者是体积较大的，一般会推荐患者通过手术进行治疗。在麻醉的状态下可以将囊肿完整的进行切除，术后规范换药，促进伤口愈合。