肛膜闭锁在诊断明确以后，一般是需要通过手术进行治疗，通过手术切除肛膜的部分，保持直肠和肛门的相通，避免出现粪便肠道内的存留，防止出现肠梗阻的情况。

　　主要的手术方法就是进行肛膜的切开以及肛门切除两种方式。目前也多是采用肛膜切除的手术方法，相对来说术后的并发症少，尤其是可以防止出现肛门狭窄的情况，避免发生肠道的梗阻。

　　在手术治疗以后，也一定要注意调整饮食结构，避免发生腹泻等情况，防止出现局部的感染，甚至是发生穿孔的情况，要合理的使用抗生素药物。