肛膜闭锁主要的治疗方法就是通过手术治疗，手术的方式一般有肛门的切开以及肛门的切除两种方式，目前在临床上也多是采用肛门切除的方法，可以减少术后复发的几率，而且可以防止发生狭窄的情况，避免出现肠道的梗阻以及粪便排出的困难。

　　肛膜闭锁在手术以后也一定要注意调整饮食结构，避免发生大便的干燥，避免出现腹泻，可以适当的使用肠道益生菌，调理肠道菌群，改善肠道内部的环境。另外肛膜闭锁在手术之后，也建议患者合理的使用抗生素药物，防止感染的发生，注意保持肛门局部的清洁，减少外来因素的影响。