永存动脉干是不能自愈的。此病属于胚胎发育缺陷，可危及生命，自然病程预后差，约出生后一年内死亡。

　　临床表现主要为：一、早期发绀，患儿多于出生后即出现发绀，并伴有心力衰竭及肺动脉高压。二、心脏杂音，可在胸骨左侧第三次肋间听见收缩期吹风样杂音或舒张期吹风样杂音。三、心脏扩大，并且心间区隆起，临床上可用超声心动图明确诊断，并可区分永存动脉干的分型及室间隔缺损的位置大小。一般建议6个月内甚至出生后进行根治术。