肠道菌群失调症通常需要配合医生进行以下检查：

　　一、粪便检查。主要包括大便饮血试验、涂片，检查白细胞、红细胞以及未消化的食物等，可以判断是否存在有肠道感染以及消化道出血的情况。而涂片查粪便细菌、真菌可以分析菌群的类型以及数量。

　　二、血液检查。主要包括血常规、血电解质、肝肾功能等检测，有助于肠道菌群失调症的鉴别诊断。

　　三、内镜检查。主要包括胃镜、结肠镜检查，必要时还需要进行胶囊内镜检查等。