巧克力囊肿一般是不会发生癌变的，但也要做到早发现早治疗，这样才可以避免病情继续加重。

　　巧克力囊肿是临床上比较常见的一种现象，属于一种良性肿瘤，恶变的几率非常低，大多数是因为子宫内膜异位症所引起期间会引发痛经、性交疼痛等现象，严重时还会造成不孕不育，一旦确诊，最好及时在医生的指导下采取药物治疗。如果药物治疗效果不佳，需要采取手术治疗，具体的治疗方法，最好到医院咨询一下医生，根据个人情况进行选择。