先天性巨结肠造成的原因主要是由于胚胎在发育的时期出现了异常，通常是在胚胎发育的第六周到第十二周，肠神经的迁移出现了异常所导致。往往是由于母体受到了多种外来不良因素的影响所引起。先天性的巨结肠还具有一定的家族遗传倾向性。

　　先天性巨结肠发生以后，主要的治疗方法是通过手术的方法进行治疗。如果患儿在出生以后不能够耐受手术的，可以先行保守治疗，加强营养的支持，防止患儿出现水电解质的紊乱以及酸碱失衡的情况，择期再行手术的治疗。术后也要注意加强护理，防止伤口出现感染。