在便秘的诊断和鉴别中，根据临床需要，应做必要的检查。首先要注意是否存在报警症状及全身其他器质性病变存在的证据。对50岁以上有长期便秘史，短期内症状加重的患者应进行结肠镜检查，以排除大肠肿瘤的可能。对于长期滥用泻剂者，结肠镜可确定是否存在泻剂性结肠或结肠黑便病。钡剂灌肠造影有助于先天性巨结肠的诊断。

　　难治性便秘，可选择特殊的检查方法，包括胃肠通过试验，直肠及肛门测压，直肠肛门反射检查，耐受性敏感性检查，气囊排出试验。盆底肌电图，阴部神经潜伏期测定试验及肛管超声检测，结肠镜检查或钡灌肠有助于确定有无器质性的病变。