肾小管酸中毒的治疗分成两个方面，第一要明确原因，要针对病因进行治疗。第二要对症处理，能够导致肾小管酸中毒的原因常常是慢性间质性肾炎干燥综合症或者是一些重金属造成的肾脏的损害。慢性间质性肾炎的患者在早期的时候可能会需要使用糖皮质激素等药物进行治疗，而干燥综合征也可能会需要使用免疫抑制剂激素等药物。因为重金属造成的损伤，患者可以使用药物来祛除身体内的这些重金属，这些针对病因进行治疗。

　　第二要处理酸中毒引起的问题，要纠正酸中毒往往需要使用枸橼酸合剂，对于低钾血症的患者需要补充钾盐，这样的患者还往往容易出现肾结石以及汞病。对于肾结石的患者可能需要外科手术干预，出现骨病的患者，可能需要使用钙剂以及骨化三醇等药物。