舌咽神经是第九对颅神经，起至脑干的延髓感染后沟前部出脑，然后和迷走神经以及副神经出颈静脉孔，在孔内神经干上有膨大的上神经节，出孔以后又形成一个稍大的下神经节。舌咽神经出颅后，先在颈内动脉和静脉之间下降，然后呈弓形向前，经蛇骨舌肌内侧到达舌根。因此如果患者存在舌咽神经痛，这些患者往往在舌根部、耳后、下颌、咽喉部会出现剧烈的疼痛症状，患者往往会出现突发突止的撕裂样、刀割样、烧灼样的疼痛。