先天性支气管囊肿是可以入职的，因为先天性支气管囊肿是胚胎发育时期气管或者是支气管出现了罕见的畸形，这种畸形如果较小，只表现为单个或者是多个发生，这种情况一般是不影响正常的呼吸以及生长发育。

　　所以，即使发现了先天性支气管囊肿也可以进行工作，也就是不会影响入职。这种疾病发现之后，主要以手术治疗为主，手术现在可以通过微创的方法进行胸腔镜手术摘除之后，预后很良好。