脊椎骨骨髓炎需要注意与相类似的疾病进行相应的鉴别，首先为脊柱结核、椎体及附件遭受破坏变形。

　　此外，椎间盘会失去正常的形态与信号，免疫性椎间盘炎可以通过影像学方法鉴别，核磁检查显示具体遭到破坏，信号成相应改变，椎间盘呈不同程度的组织肿胀、增厚或破坏。应用抗生素治疗有效是脊柱化脓性骨髓炎的诊断要点，免疫性椎间盘炎患者无细菌感染征象以及体温不高，血常规显示白细胞正常，并经抗生素治疗后无明显改善。