厌氧菌是人体内的正常菌群，因此厌氧菌感染绝大多数是属于内源性的，这些细菌是一种条件致病菌，必须在全身或局部抵抗力下降时，才能够发生侵入和感染。

　　全身性的因素，包括恶性肿瘤、白血病、糖尿病、白细胞减少症、丙种球蛋白降低，应用免疫抑制剂或细胞毒药物，脾切除、胶原病等手术外伤、营养不良、组织缺氧、组织破坏、异物，外周血管闭塞、需氧菌感染等，使局部氧化还原电位差降低的因素，均有利于厌氧菌的滋长和感染。女性生殖道的厌氧菌感染，常常发生于难产和非法流产。