孤立性直肠溃疡综合征的典型症状就是便血。不多、色鲜红或暗红，不与粪便相混合，局部感染以后还会出现脓液变。有的患者以粘液浓血便作为首发症状，有时会出现排大便困难，肛门坠胀疼痛，有的患者还伴有里脊厚重，排大便不尽感，腹泻、大便失禁等，直肠肛门疾病症状均可出现，少数患者还会出现大出血等，以血便、粘液便、排粪障碍以及肛门坠胀疼痛为主要表现。直肠指诊可于直肠下段前壁触及增厚的黏膜溃疡，并有触痛。直肠x线被击造影显示，直肠狭窄。