肺部曲霉菌感染主要是由于机体的免疫力下降，受到了曲霉菌的入侵，而使肺部粘膜出现不同程度的充血、水肿，甚至有大量炎性分泌物的渗出。一般患者会有一些慢性的基础性疾病，比如有糖尿病、白血病、再生障碍性贫血、有恶性肿瘤，比如包括肺癌，另外还有大面积的烧伤，有严重的营养不良，或者有其他的慢性消耗性疾病。在这个基础上，或者是长期使用抗生素、糖皮质激素等，都容易诱发。在抵抗力比较差的情况下，受到曲霉菌的入侵，而使肺部粘膜出现了严重的炎症反应。