肺部霉菌感染，大多数情况下是能够治疗好转的。尤其是针对于初期的肺部霉菌感染，症状比较轻微，通过敏感的抗真菌的药物的使用，比如两性霉素b、灰黄霉素、氟康唑、酮康唑等，为期6周到12周左右的时间，是能够完全将炎症控制住，并且根除的。对于稍微严重的患者还要联合使用支气管纤维内镜下去除病灶，并且局部给予抗炎药物治疗，也能达到根治。

　　如果药物无法控制的肺部的局部的病灶，还可以选择使用手术切除达到根治。只有极少数患者，因为没有及时的进行规范的治疗，甚至伴有一些慢性基础性疾病，比如白血病、肺结核、支气管、肺癌。这种情况下，抵抗力本来是比较差的，容易并发有霉菌感染，无法治愈。