曲霉菌的感染主要是由于通过皮肤粘膜、曲霉菌入侵到深部的组织和内脏而导致。另外还可见于本身的有慢性的一些基础疾病上，抵抗力比较差的情况下，容易出现机会性的感染。比如有糖尿病、白血病、再生障碍性贫血、还有恶性肿瘤，有大面积的烧伤，有严重的营养不良或者是其他的慢性消耗性疾病基础上，或者是长期使用糖皮质激素、抗生素、免疫抑制剂，从而导致机体的免疫功能下降，容易受到曲霉菌的入侵而发生感染。临床上比较常见的就是肺部的感染。