先天性肛门狭窄患者饮食应当清淡，以容易消化的食物为主。对于温热性质的动物肉，比如羊肉、牛肉、狗肉等应当禁止使用，否则会影响疾病的恢复。以下食物也应当尽量避免食用。

　　化学性刺激性的食物，比如浓茶、咖啡，机械性刺激性的食物，比如韭菜、排骨等一些烟熏的食品，比如熏鸡、熏鱼含有丰富的亚硝胺，不利于患者病情的恢复。一些脂肪含量高的食物，比如肥猪肉。含有胆固醇比较高的，比如动物内脏，不能够适用先天性肛门直肠狭窄患者，应当以清淡的多吃一些半流质饮食防止大便干燥，防止出现排大便困难。