耻骨直肠肌肥厚的原因，常见的有以下几种：

　　1、如果患者养成不良的排便习惯，长期过度用力排便，或长期使用泻剂，刺激导致盆底反射性松弛，机能不稳定，会导致耻骨直肠肌肥厚。

　　2、如果患者自幼起病，可能与肠神经系统发育的先天异常有关。

　　3、有时与神经精神因素有关，常常有精神紧张、焦虑、抑郁等表现，可能与精神状态的改变影响自主神经功能有关。

　　4、如果既往行肛肠手术，肛门部手术操作不当，容易诱发耻骨直肠肌肥厚。