肛管直肠恶性黑色素瘤早期会出现血型转移，主要转移至肝脏，引发肝脏肿大、黄疸以及腹水。还可转移至肺脏、脑骨，引起相应的临床症状。早期黑色素瘤还会发生淋巴转移，转移途径与肛管直肠的其他恶性肿瘤相同，早期可发生腹股沟淋巴结、闭孔淋巴结、腹主动脉旁淋巴结以及髂总动脉旁淋巴结转移，还可直接浸润倾及盆腔组织，与周围组织黏连会导致肠梗阻。

　　有时还会并发肠穿孔，引起了腹痛、腹胀、腹部肌紧张等弥漫性腹膜炎的症状，腹腔内容物流入腹腔还会导致感染。如果感染较重导致感染性休克，还会危及患者的生命。