巧克力囊肿可以通过做B超检查出来，做阴道彩超的时候，会显示卵巢上面有囊肿，或者盆腔里面有囊肿，这种囊肿和其他的生理性囊肿是不一样的，它有血液循环、有血供、有不均质的回声，然后这种情况再结合个人的临床症状就可以做出准确的判断。

　　有巧克力囊肿一般会出现有痛经，或者是之前有过月经期间同房史、做人工流产、做清宫这一类的手术之后，会出现继发性的痛经，这种情况就要考虑是巧克力囊肿。然后可以通过做核磁共诊来明确诊断，或者是通过抽血检查，如果出现有肿瘤标志物升高，这时候就可以做出准确的判断。